После октябрьского переворота в 1917 г. Финляндия получила независимость. Валаам оказался на ее территории, что сохранило на время обитель. 1918 год был одним из самых трудных для монастыря: голод, конфискация финскими войсками монастырского имущества. С ноября 1918 г. монастырь находился в ведении финляндской Православной Церкви, ставшей автономной и перешедшей в юрисдикцию Константинопольской Церкви. В сложных политических условиях, чтобы не прослыть "русской", Финляндская Церковь стремилась активно проводить реформы, подчеркивая свою самостоятельность. Она перешла на новый (григорианский) календарный стиль и западную пасхалию, не признаваемую другими православными Церквами. В сентябре 1925 г. во время визита на Валаам возглавлявшего Финляндскую Церковь епископа Германа (Аав) прозвучало окончательное требование принять новый стиль. Значительная часть братии отказалась сослужить с ним и греческим митрополитом Германосом, стремясь придерживаться церковных канонов. Начались гонения. Ряд монахов должны были вернуться на верную гибель в СССР, некоторые перебрались в Сербию. Изгнанные иноки принесли традиции Валаама в разные страны мира: Францию, США, Марокко, Германию. Наместник о. Иосиф, духовник о. Михаил, казначей о. Иероним и другие были лишены должностей и высланы в отдаленные скиты. На службу монахи-старостильники стали собираться в гончарной мастерской, которая стала их Церковью. Печальное разделение братии сохранялось до 1946 г когда монастырь перешел под юрисдикцию Русской Православной Церкви и был снова принят старый (юлианский) церковный календарь. Через 10 лет, после восстановления в полном объеме евхаристического и канонического общения между Русской и Финляндской православными церквами, обитель на Новом Валааме снова оказалась в составе Финляндской Церкви. Несколько наиболее ревностных и почитаемых старцев вернулись в Россию, чтобы окончить свои дни в Псково- Печерском монастыре.

К 1925 г. в обители осталось приблизительно 400 человек, из них 70 иеромонахов и 40 иеродиаконов. Около 100 наемных рабочих разрабатывали лес (раньше у православных карел был обычай перед женитьбой помолиться на Валааме и потрудиться в пользу обители). Прачечной и огородами занимались 25 богомолок, оставшихся на острове и образовавших свою "монашескую общину".

В лютеранской Финляндии Валаам в эти годы продолжал быть светильником Православной веры. Здесь ежегодно совершались съезды духовенства из 35 приходов Финляндии. Издавался журнал "Утренняя заря", книги. С 1926 г в Петропавловском храме иеромонах Исаакий начал совершать регулярные богослужения на финском языке. Работали школа-приют для 30 мальчиков, бедных и сирот в Воскресенском скиту и школа-"киновия" для мальчиков-карел. В храмах совершалось непрерывное чтение Псалтири с поминовением умерших и живых. В 1920-1930-е гг. на Валааме побывали писатели Б. К. Зайцев, М. А Янсон, А В. Амфитеатров, Е. Н. Чириков, А. Н. Толстой. Здесь принял постриг и впоследствии был похоронен на Старом Братском кладбище князь Алексей Мещерский. Средоточием духовной жизни Русского Зарубежья монастырь был вплоть до войны с Финляндией (Зимней войны) 1939-40 гг.